Aggiornamento: sostituito il "blocco" cilindro, pistone, testata con le valvole e coperchio valvole... Il problema persiste nella medesima maniera.
A questo punto penso, potrebbe essere un problema di impianto elettrico?
I due statori erano diversi, e io ho messo quello del blocco motore "nuovo" che aveva lo spinotto a tre uscite (che entra in quella che credo sia la centralina) femmina anzichè maschio (come il mio vecchio statore).
Quando ho montato il blocco mi sono limitato a sostituire lo spinotto dello statore nuovo con quello del vecchio.