Se con la carburazione sei a posto(anche il livello carburante in vaschetta?),dai una controllata per scrupolo anche a bobina e pipetta candela. Guarda se la pipetta è fessurata da qualche parte.
Ho avuto lo stesso problema sull'altra moto e prima di cavarne piede è passato parecchio tempo.
I problemi elettrici a volte sono molto simili come sintomi a quelli di carburazione.
Nel tuo caso probabilmente a regimi medio alti la scintilla perde di forza perchè la candela va a massa sulla testa.
Magari si tratta di un altro problema ma controlla anche li!